艾滋病患者多出现明显的消瘦和严重的营养不良，贫血，白细胞，血小板或全血细胞减少，长期腹泻引起水电解质紊乱神经系统的损伤，引起智力下降，反应迟钝，抑郁，忧虑类妄想狂精神病或痴呆。
心血管系统的损伤引起心动过速，心脏增大，充血性心力衰竭 。
肾功能的损伤可引起间质性肾炎和肾小管坏死，出现蛋白尿少尿高度水肿氮质血症及肾功能衰竭 。
肌肉骨骼系统的损伤可引起游走性关节炎，关节疼痛和关节腔积液酷似风湿性关节炎抗风湿治疗效果不佳亦可表现有多发性肌炎肌肉，明显压痛及活动障碍肌肉活检呈坏死性肌炎。
内分泌系统的损伤可出现肾上腺功能不全和低肾素血症，低血压持续性低血钠和高血钾甲状腺功能低下，糖尿病和肾上腺危象等艾滋病的最新研究进展。